草蔻与肉蔻都是一种温性的中药材，它们主要的区别在于来源不同、功效不同、外形不同，草蔻是一种常见的香型调味料，可有调理肠胃、清热消毒等功效，而肉蔻主要是以制作卤制品的材料为主，主要对于气喘或者腹胀等症状有很好的缓解效果。
1、来源不同
草蔻
草蔻与肉蔻虽有一字之差，但两者是不同的中药材，它们主要的区别在于来源不同，草蔻主要是属于肉豆蔻科类的干燥种仁，也是一种特有的调味料，而肉蔻主要是常绿乔木下的干燥种仁，一般是用于制作与卤料为主。
2、功效不同
肉蔻
草蔻具有很高的药用价值，它也是属于温性的，味道带有一点的辛辣味道，可具有调理肠胃、清热消毒等功效，一般是适合经常腹泻的人群服用最佳，而肉蔻是一种祛湿益气的药物，主要对于气喘或者腹胀等症状有很好的缓解效果。
3、外形不同
草蔻
草寇主要是以长圆形或者椭圆形居多，它的底端主要为三角形状，其外表的颜色为灰棕色或者褐色，果皮很硬，而肉蔻主要是以椭圆形为主，看起来也会稍微大一些，其外表的颜色以灰黄色居多。
